荷花苗是多年生水生草本；根狀莖橫生，肥厚，節(jié)間膨大，內有多數縱行通氣孔道，節(jié)部縊縮，上生黑色鱗葉，下生須狀不定根。葉圓形，盾狀，直徑25-90厘米，表面深綠色，被蠟質白粉覆蓋，背面灰綠色，全緣稍呈波狀，上面光滑，具白粉，下面葉脈從中央射出，有1-2次叉狀分枝；葉柄粗壯，圓柱形，長1-2米，中空，外面散生小刺。花梗和葉柄等長或稍長，也散生小刺；葉柄圓柱形，密生倒刺。

荷花苗單生于花梗頂端、高托水面之上，花直徑10-20厘米，美麗，芳香；有單瓣、復瓣、重瓣及重臺等花型；花瓣紅色、粉紅色或白色，矩圓狀橢圓形至倒卵形，長5-10厘米，寬3-5厘米，由外向內漸小，有時變成雄蕊，先端圓鈍或微尖，雄蕊多數；雌蕊離生，埋藏于倒圓錐狀海綿質花托內，花托表面具多數散生蜂窩狀孔洞，受精后逐漸膨大稱為蓮蓬，每一孔洞內生一小堅果；花藥條形，花絲細長，著生在花托之下；花柱極短，柱頭頂生；花托直徑5-10厘米。