水源熱泵理論上可以利用一切的水資源，其實在實際工程中，不同的水資源利用的成本差異相當大的。所以在不同地區(qū)是否有合適的水源成為水源熱泵應用的一個關鍵。能否找到合適的水源就成為使用水源熱泵的限制條件，且水源要求必須滿足一定的溫度、水量和清潔度。

對于從地下取水回灌的使用，必須考慮到所用的地質(zhì)結(jié)構(gòu)，確保可以在經(jīng)濟合理的條件下打井找到合適的水源，同時還應保持用水回灌得以實現(xiàn)。